iPhone 5の正統的な後継機種。
チップには新たにApple A7を採用し、スマートフォンでは初となる64ビットアーキテクチャとなっている。なお、アップルではCPUとGPUはiPhone 5に比べ2倍の性能と謳っている。2008年初代iPhoneからは56倍の性能。

ホームボタンは四角いアイコンがなくなり、指紋認証センサー “Touch ID” に取って代わった。
iPhoneの象徴である丸型のホームボタンには指紋認証センサーTouch IDが初めて搭載され、ホームボタンの周囲に感知リングがあり、その下にある容量性センサーによって指紋を検出する。
カラーバリエーションはこれまでの2色からゴールドの追加とブラックからスペースグレイへ変更された。
5sの「s」は指紋認証が可能になったことから「security」の頭文字ではないかという説が有力になっている。